Ang tatlong pangunahing network
- JR East: kasama ang Yamanote loop, Chuo Line at Sobu Line. Sakop ng JR Pass.
- Tokyo Metro at Toei Subway: sumasakop sa central Tokyo at maraming tourist spot. Hindi sakop ng JR Pass.
- Mga pribadong riles tulad ng Keio, Odakyu at Tobu, para sa mga lugar tulad ng Hakone at Nikko.
