სამი ძირითადი ქსელი
- JR East: მოიცავს Yamanote loop-ს, Chuo Line-ს და Sobu Line-ს. დაფარულია JR Pass-ით.
- Tokyo Metro და Toei Subway: მოიცავს ცენტრალურ ტოკიოს და ბევრ ტურისტულ ადგილს. არ არის დაფარული JR Pass-ით.
- კერძო რკინიგზები, როგორიცაა Keio, Odakyu და Tobu, ისეთი ტერიტორიებისთვის, როგორიცაა Hakone და Nikko.
