แผนที่เส้นทางชินคันเซ็น

สายรถไฟหัวกระสุนที่คึกคักและมีชื่อเสียงที่สุดของญี่ปุ่น เชื่อมต่อโตเกียวไปยังโอซาก้าผ่านนาโกย่าและเกียวโต มีบริการ Nozomi, Hikari และ Kodama

ส่วนต่อขยายของโทไคโดจากโอซาก้าไปยังฮากาตะ (ฟุกุโอกะ) ผ่านฮิโรชิมา, โอคายามะ และโกเบ รถไฟบางสายยังคงเป็น Nozomi/Mizuho

เชื่อมต่อโตเกียวไปยังภาคเหนือของฮอนชู รวมถึงเซนได, โมริโอกะ และชิน-อาโอโมริ รถไฟฮายาบูสะเป็นรถไฟที่เร็วที่สุด

ต่อจากชิน-อาโอโมริ ผ่านอุโมงค์เซคัง ไปยังชิน-ฮาโกดาเตะ-โฮกุโตะ ในฮอกไกโด มีแผนขยายไปยังซัปโปโรในอนาคต

เชื่อมต่อโตเกียวไปยังคานาซาวะ ผ่านนากาโน่และเทือกเขาแอลป์ของญี่ปุ่น เพิ่งขยายไปยังสึรุงะในปี 2024

เชื่อมโยงโตเกียวไปยังนีงาตะบนชายฝั่งทะเลญี่ปุ่น เป็นที่นิยมสำหรับแหล่งเล่นสกีและพื้นที่ปลูกข้าว

วิ่งจากฮากาตะไปยังคาโกชิมะ-ชูโอ ผ่านทางตอนใต้ของคิวชู โดดเด่นด้วยรถไฟดีไซน์คิวชูอันเป็นเอกลักษณ์

มินิชินคันเซ็นจากโตเกียวไปยังชินโจผ่านยามางาตะ ใช้รถไฟขนาดเล็กที่วิ่งบนรางรถไฟทั่วไป

มินิชินคันเซ็นจากโตเกียวไปยังอาคิตะผ่านโมริโอกะ เชื่อมต่อกับรีสอร์ทออนเซ็นและเมืองซามูไร

เส้นทางใหม่ที่เชื่อมต่อทาเคโอะ-ออนเซ็นไปยังนางาซากิ เปิดให้บริการในปี 2022 ด้วยรถไฟคาโมเมะ