Üç ana ağ
- JR East: Yamanote döngüsü, Chuo Hattı ve Sobu Hattı'nı içerir. JR Pass tarafından karşılanır.
- Tokyo Metro ve Toei Subway: merkezi Tokyo'yu ve birçok turistik yeri kapsar. JR Pass tarafından karşılanmaz.
- Hakone ve Nikko gibi bölgeler için Keio, Odakyu ve Tobu gibi özel demiryolları.
