Le tre principali reti
- JR East: include l'anello Yamanote, la linea Chuo e la linea Sobu. Coperto dal JR Pass.
- Tokyo Metro e Toei Subway: coprono il centro di Tokyo e molti punti turistici. Non coperto dal JR Pass.
- Ferrovie private come Keio, Odakyu e Tobu, per aree come Hakone e Nikko.
