Tri glavna omrežja
- JR East: vključuje obroč Yamanote, linijo Chuo in linijo Sobu. Pokrito z JR Pass.
- Tokyo Metro in Toei Subway: pokrivata osrednji Tokio in številne turistične točke. Ni pokrito z JR Pass.
- Zasebne železnice, kot so Keio, Odakyu in Tobu, za območja, kot sta Hakone in Nikko.
