Tri glavne mreže
- JR East: uključuje Yamanote kružnu liniju, Chuo liniju i Sobu liniju. Pokriveno JR Passom.
- Tokyo Metro i Toei Subway: pokrivaju centralni Tokio i mnoga turistička mjesta. Nije pokriveno JR Passom.
- Privatne željeznice kao što su Keio, Odakyu i Tobu, za područja poput Hakonea i Nikka.
